動物組織-染色質(zhì)免疫共沉淀測序（ChIP-seq）
染色質(zhì)免疫共沉淀（Chromatin Immunoprecipitation,ChIP），是研究體內(nèi)蛋白質(zhì)與DNA相互作用的經(jīng)典方法。將ChIP與高通量測序技術(shù)相結(jié)合的ChIP-Seq技術(shù)，可在全基因組范圍對特定蛋白的DNA結(jié)合位點進行高效而準確的篩選與鑒定，為研究的深入開展打下基礎。
DNA與蛋白質(zhì)的相互作用與基因的轉(zhuǎn)錄、染色質(zhì)的空間構(gòu)型和構(gòu)象密切相關(guān)。運用組蛋白特定修飾的特異性抗體或DNA結(jié)合蛋白或轉(zhuǎn)錄因子特異性抗體富集與其結(jié)合的DNA片段，并進行純化和文庫構(gòu)建，然后進行高通量測序，通過將獲得的數(shù)據(jù)與參考基因組精確比對，研究人員可獲得全基因組范圍內(nèi)某種修飾類型的特定組蛋白或轉(zhuǎn)錄因子與基因組DNA序列之間的關(guān)系，也可對多個樣品進行差異比較。
DNA與蛋白質(zhì)互作（ChIP）：提供組蛋白修飾、轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合等抗體富集、建庫測序、數(shù)據(jù)分析全流程服務。具有細胞，動、植物組織，微生物（弓形蟲、煙粉虱等）等不同樣本富集建庫經(jīng)驗。
技術(shù)優(yōu)勢：
1）物種范圍廣：細胞、動物組織、植物組織、細菌微生物多物種富集經(jīng)驗；
2）微量建庫：只需5ng以上免疫沉淀后的DNA，即可展開測序分析；
3）方案靈活：根據(jù)不同的項目需求，選擇不同的組蛋白修飾特異性抗體。
實驗策略：
分析內(nèi)容：
送樣要求：
項目案例：
標題：A meet-up of acetyl phosphate and c-di-GMP modulates BldD activity for development and antibiotic production
發(fā)表雜志：Nucleic Acids Res
影響因子：14.6
發(fā)表年份：2023
（2）微生物：煙粉虱
標題：A bacteriocyte symbiont determines whitefly sex ratio by regulating mitochondrial function
發(fā)表雜志：Cell Reports
影響因子：8.8
發(fā)表年份：2023
使用H3K9me3抗體對±HBt煙粉虱進行ChIP-seq分析
（3）細胞：小鼠
標題：ARTICLE JMJD3 acts in tandem with KLF4 to facilitate reprogramming to pluripotency
發(fā)表雜志：Nat Commun
影響因子：16.6
發(fā)表年份：2020
ChIP-seq揭示小鼠細胞重編程過程中JMJD3與KLF4協(xié)同作用
參考文獻：
① Fu Y,et al. A meet-up of acetyl phosphate and c-di-GMP modulates BldD activity for development and antibiotic production. Nucleic Acids Res. 2023 Jul 21;51(13):6870-6882.
② Yao YL,et al. A bacteriocyte symbiont determines whitefly sex ratio by regulating mitochondrial function. Cell Rep. 2023 Feb 10;42(2):112102.
③ Huang Y,et al.JMJD3 acts in tandem with KLF4 to facilitate reprogramming to pluripotency. Nat Commun. 2020 Oct 8;11(1):5061.
