羥甲基化-靶基因甲基化/羥甲基化測序（Target-oxBS+Target-BS）
靶基因亞硫酸鹽高通量測序（Target Bisulfite sequencing，Target（- ox）BS）是針對已有目標基因panel組合，運
用易基因自主研發(fā)的甲基化特異性多重PCR引物設(shè)計軟件，對亞硫酸鹽轉(zhuǎn)化或氧化亞硫酸鹽轉(zhuǎn)化后的目標基因多重
擴增，建庫后進行超高深度（1000X以上）甲基化精準檢測。
技術(shù)優(yōu)勢
1. 超高深度亞硫酸鹽甲基化測序，檢測準確性極高，完勝傳統(tǒng)BSP測序
2. 檢測靈敏度高，可準確檢測到樣本中低于1%的甲基化水平
3. 樣本需求量低，20ng基因組DNA可實現(xiàn)多基因擴增
4. 檢測費用顯著低于現(xiàn)有技術(shù)、快周期、超高性價比
5. 平行化學(xué)氧化后亞硫酸鹽測序，甲基化和羥甲基化精準檢測
6. 適用范圍廣，對基因組DNA、FFPE樣本、游離cfDNA等樣本均適用
7. 實現(xiàn)近百個基因的多重擴增，檢測通量高，優(yōu)于焦磷酸甲基化測序
實驗策略
信息分析
技術(shù)參數(shù)
研究案例
靶基因DNA甲基化測序驗證補充維C可減少后代因母親妊娠期吸煙而發(fā)生的DNA甲基化變化
Vitamin C Prevents Offspring DNA Methylation Changes Associated with Maternal Smoking in Pregnancy
1、背景：
妊娠期吸煙可能導(dǎo)致嬰兒出生后終生肺功能下降。此前已有不少研究描述了孕婦吸煙相關(guān)的的DNA甲基化變化，如在分娩時的胎盤和臍血、
胎兒肺以及兒童時期的口腔上皮和血液中。本研究為確定補充維生素 C 是否會減少后代因母親因妊娠期吸煙而發(fā)生的甲基化變化。
2、方法：
對胎盤、臍帶血樣本和口腔樣本進行靶向重亞硫酸鹽測序，然后使用靶基因DNA甲基化測序?qū)x定的臍帶血差異甲基化區(qū)域進行獨立驗證。
3、結(jié)論：
安慰劑組和非吸煙者組之間甲基化差異≥10%的大多數(shù)CpG（69.03%）在補充維生素C后，至少50%可恢復(fù)到非吸煙者水平?；謴?fù)的CpG中
有相當一部分與低甲基化CpG富集程度較高的表型結(jié)果相關(guān)。
Target（- ox）BS用于甲基化多位點甲狀腺結(jié)節(jié)診斷
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