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m6A甲基化-常規(guī)mRNA 甲基化測序（MeRIP）
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m6A甲基化-常規(guī)mRNA +lncRNA甲基化測序（lnc-MeRIP）
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m6A甲基化-微量mRNA +lncRNA甲基化測序（Micro- lnc-MeRIP）
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m5C甲基化-常規(guī)mRNA 甲基化測序（RNA-BS）
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m5C甲基化-常規(guī)mRNA +lncRNA甲基化測序（lncRNA-BS）
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m5C RNA甲基化測序（m5C MeRIP-seq）
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m1A 甲基化常規(guī)mRNA甲基化測序（MeRIP）
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m1A甲基化常規(guī)mRNA +lncRNA甲基化測序（ lnc MeRIP）
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m1A甲基化微量mRNA +lncRNA甲基化測序（ Micro lnc MeRIP）
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m7G甲基化常規(guī)mRNA甲基化測序（ MeRIP）
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m7G甲基化常規(guī)mRNA +lncRNA甲基化測序（ lnc MeRIP）
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m7G甲基化微量mRNA+lncRNA甲基化測序（ Micro lnc MeRIP）
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RNA甲基化液相色譜串聯(lián)質譜法 (LC-MS/MS)
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ac4C乙酰化RNA免疫沉淀測序（acRIP-seq）
m7G甲基化常規(guī)mRNA +lncRNA甲基化測序（ lnc MeRIP）
N7-甲基鳥苷（N7-methylguanosine，m7G）是真核生物tRNA、rRNA和mRNA 5'cap中最豐富的修飾之一。作為一種重要的表觀遺傳修飾，m7G RNA甲基化在基因表達、加工代謝、蛋白質合成、轉錄穩(wěn)定等方面發(fā)揮著重要的作用，參與疾病發(fā)生發(fā)展等多種生命過程。
對于m7G RNA甲基化修飾的檢測，易基因采用基于抗體富集的m7G-MeRIP-seq，利用m7G特異性抗體富集發(fā)生m7G甲基化修飾的RNA片段（包括mRNA、lncRNA等rRNA去除所有RNA），結合高通量測序，對RNA上的m7G修飾進行定位與定量，總RNA起始量可降低至10μg，最低僅需1μg總RNA。
技術優(yōu)勢：
1）起始量低：樣本起始量可降低至10-20μg，最低僅需1μg總RNA；
2）高通量測序：全轉錄組m7G位點高通量測序，可同時檢測mRNA和lncRNA；
3）樣本要求：可用于動物、植物、細胞及組織的m7G檢測；
4）重復性高：m7G-MeRIP-seq的IP富集重復性高，最大化降低抗體富集偏差；
5）應用范圍廣：廣泛應用于組織發(fā)育、干細胞自我更新和分化、熱休克或DNA損傷應答、癌癥的發(fā)生與發(fā)展、藥物應答等研究領域。
技術路線：
送樣要求
典型案例
哺乳動物轉錄組范圍mRNA內m7G RNA甲基化圖譜
Transcriptome-wide Mapping of Internal N7-methylguanosine Methylome in Mammalian Messenger RNA
背景：
m7G RNA甲基化在真核mRNA中的存在和分布有待研究。
方法：
本研究開發(fā)了基于抗體富集m7G RNA甲基化修飾測序方法：基于抗體富集的m7G-MeRIP-seq。
結果：
本研究作者使用m7G-MeRIP-seq對RNA內m7G甲基化進行轉錄組范圍的高通量測序分析，揭示了人和小鼠細胞內m7G甲基化水平（mRNA分布、富集的共有motif等）。另外，作者將METTL1基因鑒定為在mRNA內催化m7G修飾的一種甲基轉移酶，表明RNA內m7G甲基化可影響mRNA翻譯。
Zhang LS, et al. Transcriptome-wide Mapping of Internal N7-Methylguanosine Methylome in Mammalian mRNA. Mol Cell. 2019 Jun 20;74(6):1304-1316.e8.
圖：m7G-MeRIP-seq繪制的人和小鼠細胞系內m7G位點的轉錄組范圍分布圖
參考文獻：
Zhang LS, et al. Transcriptome-wide Mapping of Internal N7-Methylguanosine Methylome in Mammalian mRNA. Mol Cell. 2019 Jun 20;74(6):1304-1316.e8.
