甲基化-靶基因甲基化測(cè)序（Target-BS）
靶基因亞硫酸鹽高通量測(cè)序（Target Bisulfite sequencing，Target-BS）是針對(duì)已有目標(biāo)基因panel組合，運(yùn)用易基因自主研發(fā)的甲基化特異性多重PCR引物設(shè)計(jì)軟件，對(duì)亞硫酸鹽轉(zhuǎn)化或氧化亞硫酸鹽轉(zhuǎn)化后的目標(biāo)基因多重?cái)U(kuò)增，建庫(kù)后進(jìn)行超高深度（1000X以上）甲基化精準(zhǔn)檢測(cè)。
技術(shù)優(yōu)勢(shì)
1. 超高深度亞硫酸鹽甲基化測(cè)序，檢測(cè)準(zhǔn)確性極高，完勝傳統(tǒng)BSP測(cè)序
2. 檢測(cè)靈敏度高，可準(zhǔn)確檢測(cè)到樣本中低于1%的甲基化水平
3. 樣本需求量低，20ng基因組DNA可實(shí)現(xiàn)多基因擴(kuò)增
4. 檢測(cè)費(fèi)用顯著低于現(xiàn)有技術(shù)、快周期、超高性價(jià)比
5. 平行化學(xué)氧化后亞硫酸鹽測(cè)序，甲基化和羥甲基化精準(zhǔn)檢測(cè)
6. 適用范圍廣，對(duì)基因組DNA、FFPE樣本、游離cfDNA等樣本均適用
7. 實(shí)現(xiàn)近百個(gè)基因的多重?cái)U(kuò)增，檢測(cè)通量高，優(yōu)于焦磷酸甲基化測(cè)序
實(shí)驗(yàn)策略
信息分析
技術(shù)參數(shù)
研究案例
靶基因DNA甲基化測(cè)序驗(yàn)證補(bǔ)充維C可減少后代因母親妊娠期吸煙而發(fā)生的DNA甲基化變化
Vitamin C Prevents Offspring DNA Methylation Changes Associated with Maternal Smoking in Pregnancy
1、背景：
妊娠期吸煙可能導(dǎo)致嬰兒出生后終生肺功能下降。此前已有不少研究描述了孕婦吸煙相關(guān)的的DNA甲基化變化，如在分娩時(shí)的胎盤(pán)和臍血、胎兒肺以及兒童時(shí)期的口腔上皮和血液中。本研究為確定補(bǔ)充維生素 C 是否會(huì)減少后代因母親因妊娠期吸煙而發(fā)生的甲基化變化。
2、方法：
對(duì)胎盤(pán)、臍帶血樣本和口腔樣本進(jìn)行靶向重亞硫酸鹽測(cè)序，然后使用靶基因DNA甲基化測(cè)序?qū)x定的臍帶血差異甲基化區(qū)域進(jìn)行獨(dú)立驗(yàn)證。
3、結(jié)論：
安慰劑組和非吸煙者組之間甲基化差異≥10%的大多數(shù)CpG（69.03%）在補(bǔ)充維生素C后，至少50%可恢復(fù)到非吸煙者水平?；謴?fù)的CpG中
有相當(dāng)一部分與低甲基化CpG富集程度較高的表型結(jié)果相關(guān)。
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