微量細(xì)胞或DNA簡化基因組甲基化測序（ Micro DNA-XRBS）
與常規(guī)RRBS不同，高通量單細(xì)胞甲基化測序sc-RBS由于從單個細(xì)胞輸入的DNA量很少，常規(guī)方法不能保證目標(biāo)DNA在最后的擴(kuò)增過程中保持不變，因此sc-RBS在降損方面進(jìn)行細(xì)化。易基因建立的高通量單細(xì)胞甲基化測序sc-RBS技術(shù)無需純化，通過限制性內(nèi)切酶消化、接頭連接過程和在單管中轉(zhuǎn)化重亞硫酸鹽，是一種專注于將純化過程中發(fā)生的損失降至最低的方法。
應(yīng)用方向
5、性價比高：單個細(xì)胞檢測費用低至千余元。
技術(shù)路線
實驗策略
分析內(nèi)容
送樣要求
技術(shù)指標(biāo)
經(jīng)典案例
sc-RBS+RNA-seq測序揭示黃曲霉毒素B1誘導(dǎo)S期阻滯L02細(xì)胞肝毒性新機(jī)制
Single-cell sequencing reveals novel mechanisms of Aflatoxin B1-induced hepatotoxicity in S phase-arrested L02 cells
1.背景：
大量研究證據(jù)表明黃曲霉毒素B1（Aflatoxin B1 ,AFB1）誘導(dǎo)的毒性包括抑制細(xì)胞增殖、氧化應(yīng)激、DNA損傷、細(xì)胞周期阻滯和細(xì)胞凋亡，特別是針對肝臟細(xì)胞具有強(qiáng)烈的毒性。但AFB1毒性的表觀遺傳機(jī)制目前尚不清楚，需要進(jìn)一步探討。
2.方法：
本研究通過單細(xì)胞測序技術(shù)（scRNA-seq + sc-RRBS）研究AFB1誘導(dǎo)S期阻滯L02細(xì)胞肝毒性機(jī)制。
3.結(jié)論：
單細(xì)胞測序技術(shù)結(jié)果發(fā)現(xiàn)AFB1可誘導(dǎo)細(xì)胞凋亡和細(xì)胞周期S期阻滯，降低線粒體膜電位(ΔΨm)，增加活性氧(ROS)生成。通過促性腺激素釋放激素受體通路，Wnt信號傳導(dǎo)通路，TGF-β信號通路等調(diào)節(jié)DNA甲基化水平。研究結(jié)果揭示了AFB1對S期阻滯L02細(xì)胞誘導(dǎo)的肝毒性機(jī)制，其中DNA甲基化通過調(diào)控促性腺激素釋放激素受體通路、Wnt信號傳導(dǎo)通路和TGF-β信號通路發(fā)揮作用，為進(jìn)一步研究精確毒理學(xué)提供了新的探索策略，包括靶細(xì)胞選擇、多組非定向測序和通路分析。
圖：基于單細(xì)胞測序結(jié)果，研究人員提出AFB1誘導(dǎo)的S期阻滯L02細(xì)胞肝毒性調(diào)節(jié)機(jī)制的假設(shè)
