-
m6A甲基化-常規(guī)mRNA 甲基化測序(MeRIP)
-
m6A甲基化-常規(guī)mRNA +lncRNA甲基化測序(lnc-MeRIP)
-
m6A甲基化-微量mRNA +lncRNA甲基化測序(Micro- lnc-MeRIP)
-
m5C甲基化-常規(guī)mRNA 甲基化測序(RNA-BS)
-
m5C甲基化-常規(guī)mRNA +lncRNA甲基化測序(lncRNA-BS)
-
m5C RNA甲基化測序(m5C MeRIP-seq)
-
m1A 甲基化常規(guī)mRNA甲基化測序(MeRIP)
-
m1A甲基化常規(guī)mRNA +lncRNA甲基化測序( lnc MeRIP)
-
m1A甲基化微量mRNA +lncRNA甲基化測序( Micro lnc MeRIP)
-
m7G甲基化常規(guī)mRNA甲基化測序( MeRIP)
-
m7G甲基化常規(guī)mRNA +lncRNA甲基化測序( lnc MeRIP)
-
m7G甲基化微量mRNA+lncRNA甲基化測序( Micro lnc MeRIP)
-
RNA甲基化液相色譜串聯(lián)質譜法 (LC-MS/MS)
-
ac4C乙?;疪NA免疫沉淀測序(acRIP-seq)
m6A甲基化-微量mRNA +lncRNA甲基化測序(Micro- lnc-MeRIP)
m6A是RNA上最豐富的一種修飾,平均每條轉錄本有1~3個m6A修飾。易基因MeRIP-seq技術利用m6A特異性抗體富集發(fā)生m6A修飾的RNA片段(包括mRNA、lncRNA等rRNA去除所有RNA),結合高通量測序,可以對RNA上的m6A修飾進行定位與定量,總RNA起始量可降低至10μg,最低僅需1μg總RNA。廣泛應用于組織發(fā)育、干細胞自我更新和分化、熱休克或DNA損傷應答、癌癥發(fā)生與發(fā)展、藥物應答等研究領域;可應用于動物、植物、細胞及組織的m6A檢測。
大樣本量m6A-QTL性狀關聯(lián)分析,傳統(tǒng)MeRIP單個樣品價格高,通常難以承擔。易基因開發(fā)建立MeRIP-seq2技術,顯著提成IP平行性,實現(xiàn)不同樣本間相對定量,降低檢測成本。
易基因提供適用于不同科研需求的MeRIP技術:
1)m6A甲基化-常量mRNA 甲基化測序(MeRIP-seq)
2)m6A甲基化-常量mRNA +lncRNA甲基化測序(lnc-MeRIP-seq)
3)m6A甲基化-微量mRNA +lncRNA甲基化測序(Micro-lnc-MeRIP-seq)
4)高通量m6A甲基化-常量mRNA甲基化測序(MeRIP-seq2)
技術優(yōu)勢
1)起始量低:樣本起始量可降低至10-20μg,最低僅需1μg總RNA;
2)轉錄組范圍內(nèi):可以同時檢測mRNA和lncRNA;
3)樣本要求:可用于動物、植物、細胞及組織的m6A檢測;
4)重復性高:IP富集重復性高,最大化降低抗體富集偏差
5)應用范圍廣:廣泛應用于組織發(fā)育、干細胞自我更新和分化、熱休克或DNA損傷應答、癌癥的發(fā)生與發(fā)展、藥物應答等研究領域。
研究方向
m6A甲基化目前主要運用在分子機制的理論性研究
1)疾病發(fā)生發(fā)展:腫瘤、代謝疾?。ㄈ绶逝?糖尿?。?、神經(jīng)和精神疾?。ㄈ绨柶澓DY/抑郁癥)、炎癥…
2)發(fā)育和分化:早期胚胎發(fā)育、個體/組織/器官生長發(fā)育、干細胞分化與命運決定、衰老
3)環(huán)境暴露與響應:污染、抗逆、生活方式
技術路線

實驗策略

送樣要求
技術選擇

分析內(nèi)容
注:個性化分析、多組學關聯(lián)分析請聯(lián)系對接銷售或技術支持
經(jīng)典案例

參考文獻:
① Zhang X,et al.Longitudinal epitranscriptome profiling reveals the crucial role of N6-methyladenosine methylation in porcine prenatal skeletal muscle development. J Genet Genomics. 2020 Aug;47(8):466-476.